MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp34

Total Repeats: 624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008566	CCT	2	6	10	15	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_008566	CAA	2	6	24	29	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008566	GAA	2	6	68	73	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008566	ATC	2	6	124	129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008566	T	6	6	140	145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008566	TTA	2	6	206	211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008566	CTC	2	6	217	222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_008566	T	6	6	284	289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008566	AT	3	6	317	322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008566	CAA	2	6	351	356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008566	TCA	2	6	359	364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008566	CAA	2	6	366	371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008566	TCA	2	6	374	379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008566	ACT	2	6	391	396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008566	A	7	7	409	415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008566	AAC	2	6	450	455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008566	CCAA	2	8	485	492	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008566	CTG	2	6	518	523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008566	AT	3	6	534	539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008566	T	6	6	596	601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008566	A	6	6	604	609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008566	ATT	2	6	655	660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008566	TAA	2	6	686	691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008566	ATT	3	9	696	704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008566	TAT	2	6	714	719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008566	ATTA	2	8	739	746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008566	ATTA	2	8	772	779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008566	ATTA	2	8	838	845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008566	ATTA	2	8	855	862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008566	ATTA	2	8	887	894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008566	GAG	2	6	908	913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008566	GTAT	2	8	1749	1756	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008566	TTA	2	6	1785	1790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008566	A	6	6	1822	1827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008566	T	6	6	1875	1880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008566	TAA	2	6	1910	1915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008566	ATT	2	6	1925	1930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008566	TCT	2	6	1945	1950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008566	AAG	2	6	1955	1960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008566	TAAT	2	8	1981	1988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008566	ATTA	2	8	1995	2002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008566	TAA	2	6	2017	2022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008566	CAAA	2	8	2033	2040	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_008566	TA	3	6	2049	2054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008566	TTA	2	6	2069	2074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008566	AATC	2	8	2081	2088	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008566	TTA	2	6	2095	2100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008566	ATAC	2	8	2162	2169	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_008566	TGG	2	6	2170	2175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008566	GTA	2	6	2192	2197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008566	ATA	2	6	2224	2229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008566	TTA	2	6	2242	2247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008566	AAT	2	6	2257	2262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008566	TA	3	6	2276	2281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008566	A	8	8	2293	2300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008566	TAC	2	6	2344	2349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008566	A	7	7	2366	2372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008566	T	6	6	2394	2399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008566	T	6	6	2404	2409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008566	TA	3	6	2460	2465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008566	T	6	6	2466	2471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008566	TAT	3	9	2703	2711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008566	A	7	7	2741	2747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008566	GTT	2	6	2794	2799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008566	TTC	2	6	2810	2815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008566	TAT	2	6	2853	2858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008566	GCAAGT	2	12	2879	2890	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_008566	ATA	2	6	2891	2896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008566	ACTT	2	8	2911	2918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008566	ATT	2	6	2931	2936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008566	AAT	2	6	2973	2978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008566	AAG	2	6	3000	3005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008566	AT	4	8	3044	3051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008566	A	6	6	3052	3057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008566	T	7	7	3062	3068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008566	TA	3	6	3103	3108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008566	TAA	2	6	3929	3934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008566	A	6	6	3933	3938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008566	TAT	3	9	3945	3953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008566	T	6	6	3994	3999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008566	TTTC	2	8	4096	4103	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_008566	ATAAA	2	10	4112	4121	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008566	GAA	2	6	4125	4130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008566	TA	3	6	4144	4149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008566	A	6	6	4149	4154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008566	TTA	2	6	4197	4202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008566	TTAT	2	8	4221	4228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008566	TTAA	2	8	4241	4248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008566	CTT	2	6	4795	4800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008566	ATTT	2	8	4831	4838	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008566	T	9	9	4836	4844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008566	CAA	2	6	4855	4860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008566	TAT	2	6	4910	4915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008566	TAA	2	6	4919	4924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008566	ACTT	2	8	4954	4961	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_008566	T	8	8	4969	4976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008566	CTATT	2	10	5006	5015	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_008566	ATT	2	6	5028	5033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008566	TTA	2	6	5049	5054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008566	T	8	8	5074	5081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008566	A	7	7	5082	5088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008566	A	6	6	5118	5123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008566	TAA	2	6	5124	5129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008566	TA	3	6	5134	5139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008566	ATA	2	6	5489	5494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008566	ATT	2	6	5611	5616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008566	A	6	6	5624	5629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008566	TTTA	2	8	5643	5650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008566	ATTTT	2	10	5965	5974	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008566	T	6	6	5971	5976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008566	TAAA	2	8	6019	6026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008566	AT	3	6	6065	6070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008566	GCT	2	6	6081	6086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008566	T	6	6	6175	6180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008566	GCAA	2	8	6187	6194	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_008566	AT	3	6	6205	6210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008566	TTTAT	2	10	6262	6271	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008566	ATT	2	6	6301	6306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008566	AGT	2	6	6310	6315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008566	ATA	2	6	6318	6323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008566	T	7	7	6339	6345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008566	T	6	6	6347	6352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008566	ATTT	2	8	6394	6401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008566	AAT	2	6	6527	6532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008566	ATTAT	2	10	6593	6602	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008566	TAA	3	9	6610	6618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008566	TAA	2	6	6621	6626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008566	AGC	2	6	6650	6655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008566	T	6	6	6682	6687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008566	GT	3	6	6688	6693	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008566	GAAG	2	8	6701	6708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008566	A	6	6	6722	6727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008566	CA	3	6	6749	6754	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_008566	ACA	2	6	6758	6763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008566	TAA	2	6	6764	6769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008566	GAA	2	6	6778	6783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008566	ATTT	2	8	6892	6899	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008566	TA	3	6	6903	6908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008566	AT	4	8	7833	7840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008566	ATA	2	6	7846	7851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008566	ATT	2	6	7852	7857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008566	TTAA	2	8	7859	7866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008566	TA	3	6	7870	7875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008566	TTTG	2	8	7880	7887	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008566	AATAT	2	10	7894	7903	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008566	AT	4	8	7900	7907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008566	TAT	3	9	7905	7913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008566	TA	3	6	7917	7922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008566	T	6	6	7929	7934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008566	TTA	2	6	7937	7942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008566	ATT	2	6	8023	8028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008566	TAATAT	2	12	8047	8058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008566	A	8	8	8060	8067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_008566	ATTAAT	2	12	8074	8085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_008566	TAT	3	9	8147	8155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_008566	TTTTGT	2	12	8156	8167	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
157	NC_008566	ATTTA	2	10	8169	8178	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_008566	ATA	2	6	8201	8206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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303	NC_008566	A	6	6	16945	16950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_008566	TTAT	2	8	16969	16976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_008566	TTA	2	6	22922	22927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_008566	A	6	6	22949	22954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_008566	ATT	2	6	22980	22985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_008566	T	7	7	22984	22990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_008566	GAT	2	6	22996	23001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
458	NC_008566	CTT	2	6	23027	23032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
459	NC_008566	ATA	3	9	23091	23099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
460	NC_008566	AT	3	6	23101	23106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_008566	TAA	2	6	23113	23118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_008566	AGAT	2	8	23130	23137	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
463	NC_008566	ATTT	2	8	23203	23210	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_008566	T	6	6	23237	23242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_008566	A	7	7	23244	23250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_008566	AAATC	2	10	23276	23285	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
467	NC_008566	AAT	2	6	23307	23312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_008566	CA	3	6	23334	23339	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
469	NC_008566	T	7	7	23343	23349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_008566	A	7	7	23380	23386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_008566	T	7	7	23406	23412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_008566	CAT	2	6	23469	23474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
473	NC_008566	AATC	2	8	23479	23486	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
474	NC_008566	CTA	2	6	23518	23523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
475	NC_008566	AAAT	2	8	23531	23538	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_008566	ATT	2	6	23554	23559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
477	NC_008566	G	6	6	23590	23595	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
478	NC_008566	AT	4	8	23613	23620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
479	NC_008566	T	6	6	23690	23695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
480	NC_008566	TTTG	2	8	23728	23735	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
481	NC_008566	AC	3	6	23742	23747	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
482	NC_008566	TAA	2	6	23752	23757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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484	NC_008566	A	6	6	23795	23800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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487	NC_008566	TAT	2	6	23927	23932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
488	NC_008566	TAA	2	6	23991	23996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
489	NC_008566	AAAT	2	8	24016	24023	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
490	NC_008566	AAT	2	6	24053	24058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
491	NC_008566	TAT	2	6	24063	24068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
492	NC_008566	CCT	2	6	25172	25177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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496	NC_008566	TAC	2	6	25247	25252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
497	NC_008566	TTAAAT	2	12	25262	25273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
498	NC_008566	AAT	2	6	25313	25318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_008566	AAT	2	6	25325	25330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_008566	ATT	2	6	25350	25355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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